中国农业科学院作物科学研究所重大平台中心主任。主要从事作物生物学信息和分子聚合育种方面的研究工作。课题组自主研发了多型号的自动化核酸提取仪器和高通量高密度的分子标记检测系统,以及多种类型的计算生物学分析工具和组学分析流程,在作物种质资源中鉴定抗逆、优质等重要农艺性状的关键调控基因,并开发分子标记辅助和加速作物精准育种。
以CRISPR基因编辑系统为代表的基因编辑技术已成为重要基因功能研究和品种遗传改良的重要工具和研究热点,在生物学研究、人类疾病控制治疗、农经产品种质创新等领域展现出巨大的应用潜力。大规模基因编辑检测主要依赖Sanger测序鉴定单一位点及用NGS建库策略实现高通量二代测序鉴定复杂的混合位点。本流程采用高通量DNA提取设备,提取转基因后代植株基因组DNA。反应产物通过ABI 3730测序仪进行Sanger测序,并用ab1文件解读编辑位点的变化;或者通过一定的NGS建库策略,获得高通量二代测序文库,用Novaseq等二代测序仪,进行深度测序。以上数据均可以存储在大型存储硬盘挂载的服务器上,并且通过自主研发的配套生信分析流程,拆分数据,比对并提取编辑的序列。

